La microbiologie est la discipline de la biologie médicale qui permet l’identification et la caractérisation des micro-organismes (des bactéries, des champignons, des parasites ou des virus) pouvant induire des pathologies infectieuses chez l’Homme. Dans un second temps, elle permet de mettre en œuvre la stratégie thérapeutique adaptée (aide à la prescription d’antibiothérapie).
Le laboratoire de microbiologie réalise les analyses de bactériologie, virologie, mycologie et parasitologie. Cette unité est composée de 2 biologistes et 7 techniciens assurant la continuité des analyses 7 jours/7.
Cette unité est dotée des automates les plus récents :
– Ensemenceur d’échantillons automatisé, spectromètre de masse identifiant instantanément après mise en culture, tous les germes présents dans les prélèvements biologiques, incubateur automatique d’hémocultures, automate de lecture de cytologie urinaire à reconnaissance optique….
– Notre logiciel d’expertise et d’épidémiologie nous permet de suivre l’émergence de résistances bactériennes et de communiquer très rapidement avec les référents hygiénistes des établissements de soins pour une meilleure gestion des infections liées aux soins.
Nous participons activement au CLIN (comité de lutte contre les infections nosocomiales) de la plupart des établissements de soins du Béarn.
L’évolution de la résistance aux antibiotiques impose aux praticiens une antibiothérapie initiale bien adaptée au contexte clinique, thérapeutique et bactériologique. Les microbiologistes suivant constamment les recommandations de la SPILF et du CASFM, une aide à cette prescription pourra vous être proposée.
Biologie moléculaire
La biologie moléculaire est dédiée à la détection de génomes viraux, parasitaires ou bactériens.
Nous assurons la recherche de divers pathogènes par technique d’amplification génique (PCR) et plus particulièrement :
- Chlamydiae trachomatis et Neisseria gonorrhoeae et Mycoplasma genitalium dans les urines ou les prélèvements biologiques.
- Recherche des principaux germes entéropathogènes pour une réponse le jour même : Salmonelle, Shigelle, Campylobacter, Shiga toxine et des virus.
- Recherche des infections liées aux soins dues à Clostridium difficile.
- Recherche des principaux virus respiratoires : Influenzae A et B, VRS et Coronavirus SARS-CoV-2.
- Etc…
Sérologies infectieuses
La sérologie infectieuse a pour but l’identification des agents infectieux par la mise en évidence des anticorps chez le patient : sérologies de dépistage et /ou de suivi des hépatites, de la rubéole, de la toxoplamose, de la maladie de Lyme, des infections à herpes virus (CMV, EBV), des infections sexuellement transmissibles (VIH, syphilis…).